国家秘密的保密期限已满的处理方式是自行解密。根据《中华人民共和国保守国家秘密法》的规定，如果国家秘密的保密期限已满，该秘密应当自动解密。不过，机关或单位应当定期审核所确定的国家秘密，对于在保密期限内因保密事项范围调整不再作为国家秘密事项，或者公开后不会损害国家安全和利益，不需要继续保密的，应当及时解密。
需要注意的是，如果需要延长保密期限，应当在原保密期限届满前重新确定保密期限。解密的决定可以由原定密机关、单位作出，也可以由其上级机关决定。
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